En la sección de natación, tres han sido los proyectos que se han puesto en marcha hasta el momento.

 El primero de ellos, a cargo del entrenador local Antonio Concepción, duró tres temporadas (1989 - 1990 a 1991 - 1992).

Para el segundo se contrató al técnico madrileño Agustín Artiles Grujalba que consumió cinco temporadas, desde la 1992-1993 a la 1996-1997.

El ultimo de los proyectos, iniciado en la temporada 1997-1998, ha sido encomendado al entrenador catalán, Leo Armentano.

En la controlada por la F.E.N. cabe destacar a Pedro Henríquez, que en 1997 obtendría ser primero en los Campeonatos de España de la Juventud, en las pruebas de 100 mariposa, 200 y 400 metros libres.

Hay otros nadadores, en esta división, que pueden apuntar muy alto, como son los casos, entre otros, de Eleazar Rescalvo, Rafael Almeida, Raúl Alvarez y Nicolas Tejera.

En el ámbito de conjunto, lo más destacable ha sido el primer puesto nacional absoluto conseguido por la división de invidentes, en 1997.

En la otra división, en la controlada por la Federación Española de Natación, se ha mantenido un segundo puesto en el ámbito regional.

En esta sección lo más importante se ha reflejado a titulo personal, destacando sobre todos ellos al invidente con ceguera total, Miguel Deniz.

Este nadador, primer deportista del club que logra la nominación de olímpico, ha estado presente en las paraolimpiadas de Atlanta de 1.996, en donde por su séptimo puesto en 100 espalda obtuvo un diploma olímpico. Es poseedor de numerosos títulos nacionales y recordman del mundo en cuatro distancias.

Gano la Copa ONCE y al igual que su compañera de Club Paola Tirados ha sido nombrado mejor deportista del año de la provincia de Las Palmas, en 1997.

En esta división de invidentes también han destacado en el ámbito nacional, Andrés Kiguel y Dailos Marrero.