La amenaza para Microsoft.Net
Microsoft ve a Samba como una amenaza, ya que al tratarse de un software libre, el programa de licencias de Microsoft se ve desmantelado, y Samba puede trabajar como servidor de archivos para los entornos de red que funcionan con la plataforma Microsoft.Net. Aunque Microsoft se defiende argumentando que Samba no ofrece el mismo soporte para los estándares de sistemas que utiliza Microsoft, y que no soporta sistemas de archivos encriptados.

Las salidas de Samba, sin embargo, pueden venir también de la mano de otras empresas, que utilizan el software para un dispositivo servidor de impresión, en lugar de utilizar una aplicación de Microsoft, que no permite que otras empresas utilicen su sistema operativo para sus propios dispositivos servidores.

Las mejoras de la 2.2
Una de las mejoras de Samba 2.2 es su capacidad para simular una red Windows 2000 fácil de configurar, o la posibilidad de enviar a un equipo desde los servidores Samba, el software necesario para utilizar una impresora concreta.

Samba 2.2 también puede funcionar como una fuente de autenticación para Windows 2000, ya que un equipo Windows 2000 puede confundir al servidor Samba como un servidor Windows auténtico. Para llegar a implementar esta función, el equipo de desarrollo de Samba invirtió meses de investigación hasta llegar a dar con el protocolo que utiliza Microsoft para esa tarea.

Samba es un software cada vez más utilizado por desarrolladores y fabricantes como solución para integrar redes heterogéneas, y es una parte estándar de las soluciones Linux de terceras partes como Red Hat, Caldera, SuSe, Mandrake, TurboLinux, entre otras.